Los órganos de gobierno de OSTA son los siguientes:
1- Congreso Nacional.
2- Consejo Nacional.
3- Comité Nacional.
4- Comisión Ejecutiva Nacional.
5- Comisión Nacional de Garantías y Revisora de Cuentas.
El Congreso Nacional es el máximo órgano de decisión de OSTA. El Congreso aprueba las líneas estratégicas y los programas globales de acción del Sindicato para un período de cuatro años. Aprueba los Estatutos de OSTA y elige a los componentes de la Comisión Ejecutiva Nacional, a los de la Comisión Nacional de Garantías y Revisora de Cuentas y a los miembros del Comité Nacional.
El Consejo Nacional es el máximo órgano de dirección y representación de OSTA entre Congresos. El mandato del Consejo finaliza una vez aprobada la Mesa del Congreso por éste. Define las directrices estratégicas y de actividad del Sindicato en todos los aspectos, en aplicación de las decisiones adoptadas por el Congreso Nacional.
Es el órgano de consulta, análisis, debate, seguimiento y apoyo de la Comisión Ejecutiva Nacional.
Es el órgano de gestión diaria y permanente de OSTA, elegido directamente por el Congreso Nacional para un mandato de cuatro años, que se encarga de ejecutar y desarrollar las decisiones del Comité Nacional y los acuerdos del Consejo Nacional, dando cuenta de su gestión, respondiendo colegiadamente ante estos.
La Comisión Nacional de Garantías y Revisora de Cuentas, asume las funciones y competencias en orden a garantizar y tutelar los derechos que los presentes Estatutos confieren a los afiliados y a los dirigentes tanto individual como colectivamente.